La Iglesia Metodista Libre Dominicana está organizada en tres conferencias regionales.
Coordina las actividades ministeriales y académicas de la región central del país.
Director: Ver equipo
Coordina las actividades ministeriales y académicas de la región noroeste del país.
Director: Ver equipo
Coordina las actividades ministeriales y académicas de la región sureste del país.
Director: Ver equipo
Cada conferencia realiza actividades específicas para el desarrollo ministerial de su región.
Modalidad de estudio presencial en las sedes regionales.
Reuniones de confraternidad y capacitación ministerial.
Ceremonias de reconocimiento de estudiantes graduados.
Las tres conferencias trabajan en coordinación bajo la dirección nacional del seminario, manteniendo estándares académicos unificados y compartiendo recursos para la formación de líderes cristianos.
Con tres conferencias regionales, el Seminario Metodista Libre tiene presencia en todo el territorio dominicano.